MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 70999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011312	TAA	2	6	220004	220009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693794
4502	NC_011312	ACC	2	6	220161	220166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693795
4503	NC_011312	CT	3	6	220220	220225	0 %	50 %	0 %	50 %	209693795
4504	NC_011312	CAT	2	6	220281	220286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693795
4505	NC_011312	ACT	2	6	220388	220393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693795
4506	NC_011312	ACC	2	6	220417	220422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693795
4507	NC_011312	TA	3	6	220464	220469	50 %	50 %	0 %	0 %	209693795
4508	NC_011312	GC	3	6	220470	220475	0 %	0 %	50 %	50 %	209693795
4509	NC_011312	TCT	2	6	220484	220489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693795
4510	NC_011312	ACAA	2	8	220490	220497	75 %	0 %	0 %	25 %	209693795
4511	NC_011312	TAA	2	6	220623	220628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693795
4512	NC_011312	GAA	2	6	220676	220681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693795
4513	NC_011312	GTT	2	6	220721	220726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693795
4514	NC_011312	ATC	2	6	220738	220743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693795
4515	NC_011312	AT	3	6	220779	220784	50 %	50 %	0 %	0 %	209693795
4516	NC_011312	GCTT	2	8	220799	220806	0 %	50 %	25 %	25 %	209693795
4517	NC_011312	ATC	2	6	220810	220815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693795
4518	NC_011312	AAGTA	2	10	220849	220858	60 %	20 %	20 %	0 %	209693795
4519	NC_011312	GCA	2	6	220889	220894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693795
4520	NC_011312	CAG	2	6	220926	220931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693795
4521	NC_011312	A	6	6	220965	220970	100 %	0 %	0 %	0 %	209693795
4522	NC_011312	TGA	2	6	221085	221090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693795
4523	NC_011312	CTG	2	6	221127	221132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693795
4524	NC_011312	GCC	2	6	221149	221154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693795
4525	NC_011312	TACT	2	8	221195	221202	25 %	50 %	0 %	25 %	209693796
4526	NC_011312	CTT	2	6	221226	221231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693796
4527	NC_011312	TAATT	2	10	221243	221252	40 %	60 %	0 %	0 %	209693796
4528	NC_011312	AAT	2	6	221335	221340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693796
4529	NC_011312	TGT	2	6	221427	221432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693796
4530	NC_011312	AGT	2	6	221445	221450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693796
4531	NC_011312	TCA	2	6	221454	221459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693796
4532	NC_011312	TGG	2	6	221477	221482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693796
4533	NC_011312	ATC	2	6	221491	221496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693796
4534	NC_011312	TAT	2	6	221580	221585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693796
4535	NC_011312	TCAT	2	8	221609	221616	25 %	50 %	0 %	25 %	209693796
4536	NC_011312	TAA	2	6	221637	221642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693796
4537	NC_011312	CAA	2	6	221709	221714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693796
4538	NC_011312	AAAG	2	8	221740	221747	75 %	0 %	25 %	0 %	209693796
4539	NC_011312	TAAT	2	8	221780	221787	50 %	50 %	0 %	0 %	209693796
4540	NC_011312	CAT	2	6	221850	221855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693796
4541	NC_011312	AGAATG	2	12	221862	221873	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209693796
4542	NC_011312	TTAG	2	8	221918	221925	25 %	50 %	25 %	0 %	209693796
4543	NC_011312	TGC	2	6	222025	222030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693796
4544	NC_011312	AAG	2	6	222101	222106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693796
4545	NC_011312	ATT	2	6	222184	222189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693796
4546	NC_011312	GC	3	6	222254	222259	0 %	0 %	50 %	50 %	209693796
4547	NC_011312	ATA	2	6	222281	222286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693796
4548	NC_011312	CTT	2	6	222306	222311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693796
4549	NC_011312	TTG	2	6	222370	222375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693796
4550	NC_011312	CTT	2	6	222384	222389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693796
4551	NC_011312	T	6	6	222406	222411	0 %	100 %	0 %	0 %	209693796
4552	NC_011312	CAT	2	6	222412	222417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693796
4553	NC_011312	TTG	2	6	222420	222425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693796
4554	NC_011312	TGT	2	6	222463	222468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693796
4555	NC_011312	TAA	2	6	222520	222525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693796
4556	NC_011312	GAA	2	6	222529	222534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693796
4557	NC_011312	CAA	2	6	222618	222623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693796
4558	NC_011312	CCA	2	6	222638	222643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693796
4559	NC_011312	TAC	2	6	222676	222681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693796
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4561	NC_011312	AATA	2	8	222754	222761	75 %	25 %	0 %	0 %	209693796
4562	NC_011312	TAA	2	6	222897	222902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693796
4563	NC_011312	AAG	2	6	222938	222943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693796
4564	NC_011312	AACC	2	8	222995	223002	50 %	0 %	0 %	50 %	209693796
4565	NC_011312	TGT	2	6	223088	223093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693797
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4568	NC_011312	CTT	2	6	223208	223213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693797
4569	NC_011312	ATC	2	6	223257	223262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693797
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4571	NC_011312	AT	3	6	223344	223349	50 %	50 %	0 %	0 %	209693797
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4581	NC_011312	TGT	2	6	223764	223769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693797
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4583	NC_011312	CGCTT	2	10	223839	223848	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4584	NC_011312	GAAGC	2	10	223906	223915	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4585	NC_011312	GAG	2	6	223995	224000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_011312	TCTT	2	8	224082	224089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4587	NC_011312	ACTC	2	8	224185	224192	25 %	25 %	0 %	50 %	209693798
4588	NC_011312	AATT	2	8	224311	224318	50 %	50 %	0 %	0 %	209693798
4589	NC_011312	A	6	6	224355	224360	100 %	0 %	0 %	0 %	209693798
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4591	NC_011312	GC	3	6	224504	224509	0 %	0 %	50 %	50 %	209693798
4592	NC_011312	AAG	2	6	224512	224517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693798
4593	NC_011312	AACC	2	8	224620	224627	50 %	0 %	0 %	50 %	209693798
4594	NC_011312	CAG	2	6	224680	224685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693798
4595	NC_011312	CTG	2	6	224710	224715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693798
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4598	NC_011312	A	7	7	224918	224924	100 %	0 %	0 %	0 %	209693798
4599	NC_011312	GTA	2	6	224931	224936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693798
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4602	NC_011312	CTTAT	2	10	225041	225050	20 %	60 %	0 %	20 %	209693798
4603	NC_011312	GTG	2	6	225051	225056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693798
4604	NC_011312	GT	3	6	225058	225063	0 %	50 %	50 %	0 %	209693798
4605	NC_011312	AAC	2	6	225067	225072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693798
4606	NC_011312	CAA	3	9	225081	225089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693798
4607	NC_011312	ATC	2	6	225195	225200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693798
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4609	NC_011312	A	6	6	225222	225227	100 %	0 %	0 %	0 %	209693798
4610	NC_011312	ACA	2	6	225233	225238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693799
4611	NC_011312	TGA	2	6	225325	225330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693799
4612	NC_011312	TAAA	2	8	225405	225412	75 %	25 %	0 %	0 %	209693799
4613	NC_011312	AAC	2	6	225432	225437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693799
4614	NC_011312	TAT	2	6	225474	225479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693799
4615	NC_011312	GA	3	6	225494	225499	50 %	0 %	50 %	0 %	209693799
4616	NC_011312	ATAAA	2	10	225564	225573	80 %	20 %	0 %	0 %	209693799
4617	NC_011312	TTA	2	6	225600	225605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693799
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4619	NC_011312	GTT	2	6	225632	225637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693799
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4874	NC_011312	CGT	2	6	236733	236738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693812
4875	NC_011312	ATCA	2	8	236753	236760	50 %	25 %	0 %	25 %	209693812
4876	NC_011312	GCTG	2	8	236903	236910	0 %	25 %	50 %	25 %	209693812
4877	NC_011312	TGT	2	6	236914	236919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693812
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4992	NC_011312	TCT	2	6	242924	242929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4993	NC_011312	TCAAA	2	10	242935	242944	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4994	NC_011312	TCT	2	6	242968	242973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4995	NC_011312	CTT	2	6	242998	243003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4996	NC_011312	G	7	7	243040	243046	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_011312	ATG	2	6	243063	243068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4999	NC_011312	A	6	6	243142	243147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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